基于病毒学文献数据集的情报分析.pdf
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浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 基于病毒学文献的情报分析 摘要 本报告基于全球病毒学相关刊物文献进行计量分析，分为三个部 分。第一部分是病毒学文献数据集的构建与说明，第二部分是基于数 据集的冠状病毒研究分析，第三部分是基于数据集的冠状病毒检测研 究分析。本情报分析基于文献计量学，仅供参考。 数据来源 Web of Science 核心合集数据库 中国工程院工程科技机构与专家库 全球顶尖科学家数据库 Google Scholar LinkedIn ResearchGate Wikipedia …… 合作单位 中国工程院知识中心 浙江省科技项目管理服务中心 1 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 基于病毒学的情报分析数据集 2019 新 型 冠 状 病 毒 （ 2019 novel Coronavirus ， 以 下 简 称 2019-nCov）在武汉爆发，2020 年 1 月 30 日 WHO 宣布将新型冠状病 毒感染肺炎疫情列为国际关注的突发公共卫生事件（PHEIC） 。冠状病 毒（Coronaviruses、CoV）肆虐全球，成为所有人关注的焦点。 浙江大学信息资源分析与应用研究中心结合中国工程院知识中 心“工程科技机构与专家库“项目的数据建设成果，通过数据搜集与 整理完成了基于病毒学的文献数据集以供学者分析与研究，数据集构 建及说明如下。 一、病毒学关键词获取 检索 Journal of General Virology、Journal of Virology、 Virology、Advances in Experimental Medicine and Biology 、 Emerging Infectious Diseases 五本病毒学及传染病学领域期刊 2003-2020 年文献，文献类型仅包含 article 和 review， 分析了 52144 篇文献数据共 37876 个关键词，用 Bibexcel 软件将关键词分行，统 计词频，取词频大于等于 13 的关键词，筛选获得 976 个高频词，并 生成共现关键词对，取共现次数大于等于 5 的关键词对共 1046 对。 二、数据集构建 以 1046 对关键词对为检索式，在 Web of Science 数据库 275 种 医学权威期刊（期刊列表见附件）中检索标题、关键词和摘要字段， 限定条件为 2003-2018 年文献类型为 Article 或 Review 的文献，命 中文献 322094 篇。 三、数据说明 本中心对以上 322094 篇文献元数据进行了作者、机构、国别等 信息的拆分，共获取 1839840 条作者机构信息。 基于上述信息，我们发现 2003 年 SARS 之后，全球病毒学研究有 一些统计学上的表现，其中发文排名前十的学者见表 1。 2 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 作者 机构 Haynes, Barton F. Montefiori, David C. Mascola, John R. Diamond, Michael S. Wilson, Ian A. Akira, Shizuo Kwong, Peter D. Croce, Carlo M. Rice, Charles M. Flavell, Richard A. Duke Univ Duke Univ NIAID Washington Univ Scripps Res Inst Osaka Univ NIAID Ohio State Univ Rockefeller Univ Yale Univ 发文数 167 153 147 143 141 139 118 109 107 102 被引总次数 17263 10456 15366 12397 15814 17204 12939 18781 11002 10160 表 1 全球病毒学 TOP10 发文学者 利用荷兰莱顿大学科技研究中心（The Centre for Science and Technology Studies, CWTS）的 van Eck 和 Waltman 于 2009 年开发 的一款基于 JAVA 的免费软件 VOSviewer，发文排名第一的作者 “Haynes, Barton F.”的合作者网络如下图 1 所示（注：并未显示 所有合作者，VOSviewer 对显示节点数要求在 1000 个左右） 。 图 1 Haynes, Barton F.的合作者网络 同时，发文排名第三的作者“Mascola, John R.”的合作者网络 如下图 2 所示，可以发现他和发文排名第一的“Haynes, Barton F.”、 发文排名第二的“Montefiori, David C.”都有密切合作。 3 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 2 Mascola, John R.的合作者网络 病毒学研究前 10 的研究机构见表 2，可视化见图 3。 机构 发文数 被引总次数 Harvard Univ 8182 888658 Univ Penn 4001 303270 Univ Calif San Francisco 3908 353407 Univ Texas MD Anderson Canc Ctr 3759 291626 Univ Washington 3599 302095 Johns Hopkins Univ 3488 313013 NCI 3485 256780 Univ Michigan 3361 233242 Univ Calif San Diego 3205 291239 Univ Pittsburgh 3127 208020 表 2 全球病毒学 TOP10 发文机构 4 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 3 全球病毒学机构合作网络分析 由上图可知，发文第一的哈佛大学与牛津大学、东京大学、墨尔 本大学、中科院等机构有较为紧密的合作研究关系。 全球病毒学研究的主要学者和机构分布国家列于表 3。 国家 发文数 被引总次数 USA 117987 7322926 Germany 22482 1440937 China 22363 898938 England 21535 1514743 France 15103 987206 Canada 13515 900383 Japan 13453 745518 Italy 11944 821172 Netherlands 9669 693367 Spain 8646 568581 表 3 全球病毒学 TOP10 发文国家 其中，中国是发文排名第三的国家，其跨国合作网络分析如图 4 所示。 5 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 4 中国的跨国合作网络分析 上述数据集若机构与学者有需要进一步分析研究，请与浙江大学 信息资源分析与应用中心陆老师联系获取（gqlu@zju.edu.cn） 。 6 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 基于病毒学文献数据集的冠状病毒研究情报分析 浙江大学文献信息分析与应用研究中心（https://ciraa.zju. edu.cn/）、中国工程院知识中心中国工程科技机构与专家库（http: //expert.ckcest.cn）课题组基于 Web of Science 数据库，利用关 键词对法构建发布了病毒学研究文献数据集，涵盖了病毒学领域 200 3-2018 的研究文献 322094 篇，1839840 条学者与研究机构信息，我 们基于上述数据集进行了一些分析与探索，希望有助于学者的进一步 合作与研究。 一、病毒学及传染病学研究概况 采用构建的相关研究数据集，统计数据按学者姓名和其所在机构 聚类，如同机构同名学者将被认为是一位学者。我们对发文量前 20 的学者的研究内容进行聚类，按发文量指标进行排序后，得到前 20 的学者数据如表 4 所示。 作者 机构 发文数 研究方向 被引 总次数 HIV-1, vaccine, broadly neutralizing Haynes, Duke Univ 167 antibodies, HIV vaccine, innate 17263 Barton F. immunity Montefiori, Duke Univ 153 vaccine,HIV,HIV-1,vaccines,antibodies 10456 David C. neutralizing antibodies, HIV-1, broadly Mascola, NIAID 147 neutralizing antibodies , human 15366 John R. immunodeficiency virus, vaccines Diamond, Washington flavivirus, Zika virus, viral pathogenesis, 143 Michael S. Univ Wilson, Scripps Res Ian A. Inst 12397 alphavirus, chikungunya virus X-ray crystallography, broadly 141 neutralizing antibodies, HIV-1 vaccine, 15814 Env, crystal structure Akira, innate immunity, signal transduction, Osaka Univ Shizuo 139 17204 NF-kappa B, TLR, cytokine 7 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION Kwong, HIV-1, intranasal vaccine, live attenuated NIAID 118 Peter D. Croce, 12939 vaccine, respiratory syncytial virus, CD4 Ohio State microRNA, lung cancer, cancer, cell 109 Carlo M. Univ Rice, Rockefeller 18781 signaling, microRNAs viral hepatitis, Liver Disease, Antiviral, 107 Charles M. Univ 11002 ApoE, HCV Flavell, caspase-1, ASC, Inflammation, NLRP3, Yale Univ 102 Richard A. 10160 colon cancer 表 4 病毒学及传染病学活跃研究者 图 5 病毒学及传染病学活跃研究者主要研究方向 二、冠状病毒的研究 将上述专家研究方向按云图展示发现病毒学领域的主要研究关 注是艾滋病（HIV）,而冠状病毒是一个相对细化的分支，因此病毒学 TOP20 的学者中并没有研究者以 coronavirus（冠状病毒）作为主要 研究方向。 为此我们从数据集中抽取 coronavirus 有关的关键词数据共计 22 个关联关键词，主要内容为冠状病毒及具体症状，如：MERS、 MERS-CoV、severe acute respiratory syndrome (SARS)、SARS virus 等，除此之外，也有一些上级词汇，如：Evolution（进化） 、Vaccine （疫苗）等，如下图。 8 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 6 冠状病毒关联研究分布 通过对冠状病毒研究的共词，按出现最早年份排序，可以获得冠 状病毒研究的研究过程树。从图 7 中可以看出冠状病毒的研究源于自 身免疫性（Autoimmunity）研究（1990 年），其下级节点包含 SARS （2003 年）,MERS（2014 年）, 突刺蛋白 (Spike Protein，2017 年), 猪流行性腹泻病毒 (PEDV，2019 年)。其中 SARS 有关论文发文年度 为：2003-2018，共计 155 篇；MERS 有关论文发文年度为：2014-2018， 共计 1829 篇。由上述数据可知，MERS 所引发的关注远比 SARS 集中 而持久，由于其超高的致死率，学术界对其倾注了极大的研究资源。 9 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 7 冠状病毒研究过程树 通过上述冠状病毒相关的 22 个关键词对，在数据集中二次检索 收敛获取冠状病毒 TOP20 研究学者结果（因为发文数量并列，实际选 取 23 名）如表 5 所示。 姓名 机构 Yuen, Kwok-Yu ng Baric, Ralph S. Perlman, Stanley Drosten, Christian Univ Hong Kong Univ N Carolina Univ Iowa Univ Bonn Univ Hong Kong Univ Hong Kong Univ Bonn Erasmus MC Peiris, JSM Chan, KH Mueller, Marcel A. Haagmans , Bart L. 发 文 数 研究方向 被引 45 coronavirus,MERS-CoV,influenza,MERS,vaccine 7996 42 36 32 coronavirus,vaccine,norovirus,MERS-CoV,emerging pathogen MERS-CoV,MERS,coronavirus,interferon,DPP4/CD 26 evolution,MERS-coronavirus,coronavirus,pathogene sis,viral load 2163 1246 2898 23 influenza A, virus evolution, SARS, SARS-coronavirus seroprevalence, children 6009 21 SARS,SARS-coronavirus seroprevalence,children,cytokine,human avian 5316 21 20 evolution, E3 ubiquitin ligase RCHY1, Ebola virus, MERS, MERS-Coronavirus MERS-CoV, coronavirus, MERS, Middle East respiratory syndrome coronavirus (MERS-CoV), 10 2036 1857 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION Rottier, Peter J. M. Denison, Mark R. Guan, Y Meyerholz , David K. Poon, LLM Memish, Ziad A. Weiss, Susan R. Woo, Patrick C. Y. Li, Fang Snijder, Eric J. Zhao, Jincun Gerber, Susan I. Jiang, Shibo Lau, Susanna K. P. Rottier, PJM Univ Utrecht Vanderbi lt Univ Univ Hong Kong Univ Iowa Univ Hong Kong Minist Hlth Univ Penn Univ Hong Kong Univ Minneso ta Leiden Univ Univ Iowa Ctr Dis Control & Prevent New York Blood Ctr Univ Hong Kong Univ Utrecht 20 18 SARS CHO 15B cells,CHO lec1 cells,LC3,N-linked glycosylation,PEDV coronavirus,ExoN,MHV,exoribonuclease,innate immunity 1307 907 18 influenza A, virus evolution, angiotensin-converting enzyme 2, coronavirus, cytokine 5961 17 cystic fibrosis, MERS, coronavirus, inflammation, interferon 476 17 cytokine,human avian,influenza A,virus evolution 5466 16 MERS-CoV,screening,viral load,Ct value,HCV 2334 15 coronavirus,2-5A,ExoN,MHV,Nidovirales 448 15 Middle East, coronavirus, deltacoronavirus, falcon,houbara bustard 1038 14 MERS-CoV, receptor-binding domain, spike protein, MERS, MERS-related coronavirus 552 14 14 genetic recoding, +RNA, ISG15, Nidovirales, coronavirus MERS-CoV, MERS,crystal structure, humanization, neutralizing monoclonal antibody 429 519 13 MERS-CoV, Middle East respiratory syndrome, coronavirus, EMC-CoV,Jordan 349 13 gp41,peptide,MERS-CoV,Anti-HIV agents,HIV-1 gp41 524 13 Middle East, coronavirus, deltacoronavirus, falcon,houbara bustard 862 13 Coronavirus, RNAi, virus infection, PEDV, nidoviruses 1195 表 5 主要研究学者 从表 5 可以看到香港大学的袁国勇（Yuen,Kwok-Yung）院士以相 关研究成果 45 篇位列第一。同时,在冠状病毒研究 TOP20 学者中,香 港大学学者占据 7 位。可见我国香港地区对冠状病毒有着持久的研究 和长足的人才储备,未来极有可能在此领域产生重要的学术成果和解 决方案。 我们以袁国勇院士为例进行文献计量分析。 11 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 8 袁国勇院士 袁国勇，中国工程院院士,2001 年至 2011 年担任香港大学微生 物学系主任,2005 年担任香港大学新发传染性疾病国家重点实验室首 任主任,2020 年,担任国家卫生健康委员会高级别专家组成员。 袁国勇院士在 2013-2018 年间对冠状病毒和 SARS 的研究共计发 文 29 篇,在发现引起非典型肺炎的病原体方面,袁国勇院士发挥了关 键作用,并在《柳叶刀》上发表了第一篇关于甲型 H5N1 流感的临床和 实验室诊断论文。 截止 2019 年,袁国勇院士已在《Lancet》 、 《New England Journal of Medicine》 、 《Science》 、 《Journal of Virology and PNAS》等顶 级医学期刊发表超过 900 篇学术论文,被引用超过 36000 次,主要的研 究方向如图 9 所示,近期主要 SCI 医学期刊发文情况如图 10 所示。 图 9 袁国勇院士研究关键词图谱 12 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 10 袁国勇院士近期发文情况 我们同时通过中国工程科技机构与专家库网站检索“冠状病毒”， 发现袁院士也是相关研究领域专家推荐的榜首。 图 11 中国工程科技机构与专家库检索页面 通过对冠状病毒关联文章中的机构进行聚类,得到冠状病毒主要 研究机构如表 6 所示,以香港大学位居首位。其中,中国的冠状病毒的 主要研究机构有香港大学、中国科学院、中国医学科学院。 研究成 研究专 果 家 Univ Hong Kong 108 415 104 28 Univ Utrecht 61 115 90 22 Univ N Carolina 60 103 69 10 Univ Iowa 49 79 64 18 Chinese Acad Sci 38 199 68 9 机构名称 13 合作机构 关联国家和地 区 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION NIAID 38 143 39 10 Ctr Dis Control & Prevent 36 202 51 14 Univ Bonn 35 38 134 31 Minist Hlth 28 83 72 16 Vanderbilt Univ 25 46 33 8 Leiden Univ 25 63 25 12 Erasmus MC 24 50 51 20 Univ Penn 24 51 31 6 Univ Texas Med Branch 20 39 24 6 Natl Inst Infect Dis 20 44 24 5 Chinese Acad Med Sci 20 96 37 6 Univ Minnesota 19 25 28 5 Loyola Univ 19 40 23 7 Purdue Univ 18 35 20 5 Scripps Res Inst 18 78 26 9 New York Blood Ctr 18 47 22 3 Inst Pasteur 16 29 44 13 Harvard Univ 15 42 36 10 Univ Tennessee 15 23 11 2 CSIC 15 38 6 3 表 6 冠状病毒研究主要机构 全球对冠状病毒研究的国家有 55 个,覆盖亚洲、欧洲和美洲的绝 大部分国家和地区,其研究热度分布如图 12 所示。可以明显看到，热 点研究区域主要集中在美国和中国，我们预计，对于此次疫情的防控 和治疗方案也将依赖中美两国的研究与合作取得突破。 图 12 冠状病毒主要研究机构分布 14 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 基于病毒学文献数据集的冠状病毒检测研究情报分析 浙江大学文献信息分析与应用中心联合中国工程院知识中心中 国工程科技机构与专家库课题组基于 Web of Science 数据库，利用 关键词对法构建发布了病毒学研究文献数据集。该数据集涵盖了病毒 学领域 2003-2018 的研究文献 322094 篇，我们联合浙江省科技项目 管理服务中心，利用上述数据集就“冠状病毒检测”进行了一些文献 计量分析，希望有助于学者的进一步合作与研究。 一、冠状病毒检测数据集构建 经文献调研和专家意见，关于冠状病毒及病毒检测的关键词主要 有： 1. 冠 状 病 毒 ： Coronaviruses ， 2019-nCoV ， SARS-Cov-2 ， COVID-19； 2. 荧光定量 PCR 检测技术：RT-PCR, qPCR, rRT-PCR； 3. 数字 PCR 检测技术：digtial PCR, dPCR； 4. 新 一 代 测 序 / 二 代 测 序 检 测 技 术 ： Next generation sequencing，NGS； 5. 三代测序检测技术：Nanopore，Picbio； 6. 元基因组下一代测序检测技术：mNGS（Metagenomic next generation sequencing） ； 7. CT 扫描检测技术：Computed Tomography，CT。 将以上关键词与“virus”和“detection”等组合成 58 对关键 词对 以 58 对关键词对为检索式，在前述病毒学文献数据集中检索标 题、作者关键词和摘要字段，命中文献 2613 篇，进行作者、机构、 国别等信息的拆分，共获取 15169 多条作者机构信息。 基于以上文献提取关键词，利用荷兰莱顿大学科技研究中心（The Centre for Science and Technology Studies, CWTS）的 Van Eck 和 Waltman 于 2009 年开发的一款基于 JAVA 的免费软件 VOSviewer，分 析冠状病毒“Coronavirus”与其他关键词的共现网络如图 13，可见 其与 SARS 病毒（Severe Acute Respiratory Syndrome） 、中东呼吸 15 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 综合征冠状病毒（MERS-CoV） 、流感（influenza） 、传播（transmission） 和干扰素（interferon）等密切相关。 图 13 冠状病毒“Coronavirus”的关键词共现网络 进一步，将关键词按照时间排序获得全球冠状病毒检测文献的关 键词时间演化图如图 14。可以发现从 2003 年主要研究 SARS 和逆转 录 - 聚 合 酶 链 反 应 （ RT-PCR ） 检 测 技 术 ， 到 中 期 的 研 究 炎 症 （Inflammation）、基因表达（Gene expression），再到近几年的热 点：冠状病毒（Coronavirus）、下一代基因测序（Next generation sequencing）和流感（Influenza） 。最新的热点只有中东呼吸综合征 冠状病毒（MERS-CoV），其他并未很集中的显示（无红色大节点的出 现） 。 图 14 全球冠状病毒检测研究文献的关键词时间演化图 16 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 二、冠状病毒检测研究者分析 基于上述信息，我们发现 2003 年 SARS 之后，全球冠状病毒检测 研究有一些统计学上的表现，其中发文排名前十的学者见表 7，其中 有三名学者来自香港大学，两名学者来自德国波恩大学。如果跟之前 分析的冠状病毒研究领域的 TOP10 学者（表 8）对比，有 80%的重合 度。可见冠状病毒研究领域的重要方向就是检测技术，而香港大学无 疑占据了十分重要的地位。 学者 机构 发文量 被引总次数 篇均被引 Baric, Ralph S. Univ N Carolina 39 2081 53.36 Perlman, Stanley Univ Iowa 38 1230 32.37 Drosten, Christian Univ Bonn 26 2528 97.23 Yuen, Kwok-Yung Univ Hong Kong 25 2049 81.96 Rottier, Peter J. M. Univ Utrecht 24 1426 59.42 Haagmans, Bart L. Erasmus MC 22 1990 90.45 Mueller, Marcel A. Univ Bonn 20 2077 103.85 Woo, Patrick C. Y. Univ Hong Kong 20 1305 65.25 Denison, Mark R. Vanderbilt Univ 20 929 46.45 Lau, Susanna K. P. Univ Hong Kong 18 1129 62.72 表 7 全球冠状病毒检测研究 TOP10 发文学者 姓名 机构 发文数 被引 Yuen, Kwok-Yung Univ Hong Kong 45 7996 Baric, Ralph S. Univ N Carolina 42 2163 Perlman, Stanley Univ Iowa 36 1246 Drosten, Christian Univ Bonn 32 2898 Peiris, JSM Univ Hong Kong 23 6009 Chan, KH Univ Hong Kong 21 5316 Mueller, Marcel A. Univ Bonn 21 2036 Haagmans, Bart L. Erasmus MC 20 1857 Rottier, Peter J. M. Univ Utrecht 20 1307 17 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION Denison, Mark R. Vanderbilt Univ 18 907 表 8 全球冠状病毒研究 TOP10 发文学者 利用 VOSviewer 软件， 可以显示所有学者的合作者网络（图 15） 。 其中排名第一的北卡罗来纳大学“Baric, Ralph S.”与排名第九的 范德堡大学“Denison, Mark R.”有密切合作（共同发文 4 篇），与 排名第二的爱荷华大学“Perlman, Stanley”共同发文 2 篇，与排名 第十的宾夕法尼亚大学“Weiss, Susan R.” 共同发文 1 篇。这四位 作者的合作主要基于冠状病毒（Coronavirus） 、中东呼吸综合征冠状 病毒（MERS-CoV）、核穿梭蛋白（Nuclear Shuttle Protein, NSP）、 刺突蛋白（Spike Protein）和基因组（Genome）等。 波恩大学的两名学者“Drosten, Christian”和“Mueller, Marcel A.”合作密切，共同发文 21 篇，另外两人也与排名第六的伊荷兰拉 斯姆斯大学医学中心的“Haagmans, Bart L.”合作发文 3 篇。其研 究重点主要是中东呼吸综合征冠状病毒 （MERS-CoV）、冠状病毒 （Coronavirus）、抗体（Antibody）、中东呼吸综合征冠状病毒的一 大宿主为骆驼（ Camel）或单峰骆驼（ Dromedary ）、人畜共患 病 （Zoonotic）等。 香港大学的三位学者：袁国勇（Yuen,Kwok-Yung） 、胡釗逸（Woo, Patrick C. Y.）和 Lau, Susanna K. P.（劉嘉珮）共同发文 17 篇， 合作紧密，体现了港大病毒研究的师承关系。另外，袁国勇与排名第 二的爱荷华大学“Perlman, Stanley”也合作发文 1 篇。由此可知， 全球冠状病毒研究领域的专家互相之间合作广泛，并没有明显的地域 和机构障碍。 图 15 全球冠状病毒检测研究的合作者网络 18 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 三、冠状病毒检测研究机构分析 全球冠状病毒检测研究前 10 的研究机构见表 9，其合作网络可 视化见图 16。发文机构排名第一的香港大学与中国科学院和美国的 疾病控制中心 CDC（Ctr Dis Control & Prevent）有密切的合作， 如图 17 所示。而表 9 中具有最高篇均被引的华盛顿大学应该具有很 好的理论研究和储备。 机构 发文量 被引总次数 篇均被引 Univ Hong Kong 65 4097 63.03 Univ N Carolina 56 4138 73.89 Univ Utrecht 55 3363 61.15 Ctr Dis Control & Prevent 49 1775 36.22 Univ Iowa 47 1994 42.43 Univ Washington 43 4564 106.14 Chinese Acad Sci 42 2339 55.69 Univ Bonn 41 3433 83.73 Minist Hlth 33 3024 91.64 Johns Hopkins Univ 33 2726 82.61 表 9 全球冠状病毒检测研究 TOP10 发文机构 图 16 全球冠状病毒检测研究的机构合作网络 19 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 17 香港大学的机构合作网络 针对香港大学发文的 65 篇文献分析其合作机构，其跨机构合作 情况如表 10 所示。与广东省疾病预防控制中心的合作最多，达 6 篇， 其关键词词云图见图 18；其次与浙江大学和中国科学院各合作发文 5 篇， 其关键词词云图见图 19 和图 20； 另外与 9 家机构合作发文 3 篇。 港大与广东的合作主要在冠状病毒来源研究，而与浙江大学和中科院 的合作都聚焦于 MERS-CoV，同时与浙大还有关于 H7N9 的合作研究。 机构 合作论文数 被引总次数 篇均被引 Guangzhou Ctr Dis Control & Prevent 6 570 95.00 Zhejiang Univ 5 752 150.40 Chinese Acad Sci 5 242 48.40 Govt Hong Kong Special Adm Reg 3 370 123.33 New York Blood Ctr 3 235 78.33 Peking Union Med Coll 3 179 59.67 King Faisal Univ 3 173 57.67 St Jude Childrens Res Hosp 3 170 56.67 Cent Vet Res Lab 3 102 34.00 Guangzhou Med Univ 3 94 31.33 Univ Iowa 3 94 31.33 Inst Pasteur 3 75 25.00 表 10 香港大学跨机构合作情况 20 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 18 香港大学与广东省疾病预防控制中心合作论文关键词词云图 图 19 香港大学与浙江大学合作论文关键词词云图 21 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 20 香港大学与中国科学院合作论文关键词词云图 由表 11 可见，波恩大学与荷兰的乌得勒支大学、德国传染病研 究中心都有紧密合作，分别共同发文 9 篇，其关键词词云图见图 21 和图 22；同时与 Euroimmun 公司合作发文 7 篇，其关键词词云图见 图 23。这些合作聚焦于 MERS 和抗体研究。特别是与 Euroimmun 公司 合作中涉及的关键词：抗体（Antibody）、血清学（Serology）、血 清（Serum）和采样（Sampled）等，意味着在检测技术上有较深入的 合作研究。 机构 合作论文 数 被引总次数 篇均被引 Univ Utrecht 9 1580 175.56 German Ctr Infect Res 9 585 65.00 EUROIMMUN AG 8 750 93.75 Minist Hlth 7 611 87.29 Univ Bern 6 130 21.67 Indiana Univ Sch Med 5 484 96.80 Alfaisal Univ 5 406 81.20 Bernhard Nocht Inst Trop Med 5 306 61.20 Hannover Med Sch 5 192 38.40 22 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION Erasmus MC 4 953 238.25 Int Livestock Res Inst 4 255 63.75 表 11 波恩大学跨机构合作情况 图 21 波恩大学与荷兰乌得勒支大学合作论文关键词词云图 图 22 波恩大学与德国传染病研究中心合作论文关键词词云图 23 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 23 波恩大学与 Euroimmun 公司合作论文关键词词云图 全球冠状病毒检测研究的主要学者和机构分布国家列于表 12。 国家 发文量 被引总次数 篇均被引 USA 829 37164 44.83 China 267 11015 41.25 Germany 165 9031 54.73 England 163 11256 69.06 Netherlands 149 8367 56.15 France 110 6145 55.86 Japan 82 2800 34.15 Canada 71 5111 71.99 Spain 68 2850 41.91 Switzerland 66 4241 64.26 表 12 全球冠状病毒检测研究 TOP10 发文国家 24 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 四、冠状病毒检测研究热点分析 对 2613 篇文献被引次数前十的文章进行研究热点分析（图 24）， 可见其形成了 6 个研究热点。比如红色节点部分（图 25）主要为冠 状病毒（Coronavirus） 、牛细小病毒（Bovine parvovirus） 、小鼠微 小病毒（Minute virus of mice） 、犬细小病毒（Canine MVC） 、呼吸 道病毒（Respiratory syncytial virus）的检测鉴定，检测技术包 括基于核苷酸测序（Nucleotide sequencing）的 DNA 测序检测手段。 蓝色节点部分（图 26）的主要为 SARS 病毒的研究，包括 SARS 病毒 与信使 RNA （Messenger RNA expression ）之间的关系； 羧肽酶 （Carboxypeptidase）同源物和氨肽酶 N(Aminopeptidase-N)是 SARS 病毒的细胞受体。绿色节点部分（图 27）主要是流感（Influenza） 、 登 革 热 （ Dengue ）、 基 孔 肯 雅 热 （ Chikungunya ） 和 弯 曲 杆 菌 （Campylobacter）的诊断和治疗等。 图 24 被引次数 TOP10 文献的研究热点 25 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 25 红色节点的研究热点 图 26 蓝色节点的研究热点 26 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 CENTER FOR INFORMATION RESOURCES ANALYSIS &APPLICATION 图 27 绿色节点的研究热点 从时间演化来看，研究热点从 2003 年的各种病毒的检测鉴定到 基 因 检 测 到 2018 年 主 要 研 究 登 革 热 （ Dengue ）、 基 孔 肯 雅 热 （Chikungunya）的诊断（图 28） 。 图 28 被引次数 TOP10 文献研究热点的时间演化 浙江大学信息资源分析与应用研究中心 中国工程院中国工程科技知识中心 浙江省科技项目管理服务中心 2020.2 27